informations générales
Archamps
Nous recherchons un(e) ingénieur(e) en analyses protéomiques et spectrométrie de masse cadre projet européen intitulé « WildPosh » (https://wildposh.eu/).
Contexte scientifique
La faune et la flore sauvages sont confrontées à des perturbations environnementales caractérisées par des changements environnementaux mondiaux (évolutions climatiques, pollution atmosphérique, pesticides, agents pathogènes et espèces exotiques). Les insectes pollinisateurs sont confrontés à ces stresseurs environnementaux et en particulier les pesticides dont les effets sub-létaux ne sont généralement pas détectés par les normes actuelles d'analyse et la réglementation repose principalement sur les abeilles mellifères au détriment des pollinisateurs sauvages.
Notre laboratoire est spécialisé en études protéomiques et spectrométrie de masse (MS) multimodales. Pour cela, nous étudions la composition en peptides et protéines du sang et tissus de pollinisateurs.
Vous ambitionnez d'atteindre avec les partenaires de WildPosh les objectifs suivants :
1. Quantifier grâce â des outils de spectrométrie de masse les risques d'exposition aux pesticides pour des pollinisateurs sauvages représentatifs.
2. Déterminer l'impact de pesticides sur la santé de ces pollinisateurs (expériences laboratoire et en serre) en suivant la composition moléculaire de deux de leurs tissus.
3. Développer des bases de données protéomiques sur la base des analyses effectuées.
4. Proposer de nouveaux outils basés sur des analyses protéomiques d'évaluation des risques sur les pollinisateurs sauvages.
Vos missions au sein de votre laboratoire BioPark seront de :
1. Suivre les plans expérimentaux convenus avec les partenaires, et assurer la traçabilité des échantillons biologiques fournis par ceux-ci.
2. Se former à partir d'échantillons déjà disponibles au laboratoire et issus d'autres projets sur les pollinisateurs.
3. Mettre en place des procédures standardisées pour les analyses et le traitement des données générées (outil R privilégié).
4. Collecter et préparer des matrices biologiques dérivés des espèces de pollinisateurs étudiés et réaliser les analyses protéomiques par MS (MALDI, LC-ESI-MS/MS).
5. Construire les bases de données protéiques et traiter les données acquises en lien avec les données générées par les autres partenaires.
6. Respecter les bonnes pratiques de laboratoire et d'éthique concernant les modèles animaux que vous aurez à manipuler.
7. Présenter en anglais les résultats du projet (réunions et rapports d'avancement, articles scientifiques et présentations orales) et participer aux différentes réunions impliquant les partenaires et la commission européenne.
Vos missions se feront sous la responsabilité directe hiérarchique du directeur du BioPark en concertation avec les autres personnes impliquées dans ce projet.
Compétences recherchées :
- Savoir-faire et pratique effective en préparation d'échantillons biologiques, en analyses de protéines par MS (MALDI et chromatographie liquide couplée à la MS). Les équipements confiés seront (i) MALDI Sirius, (ii) Q-Exactive, (iii) Ultimate U3000 et (iv) HPLC Agilent 2590.
- Traitement de données bio-informatiques ;
- Capacités à travailler en autonomie tout en ayant un esprit d'équipe ;
- Esprit de communication, rédaction des rapports et articles scientifiques (anglais) ;
- Des connaissances dans la rédaction d'articles scientifiques en anglais seraient un plus.
Mots clés : Pollinisateurs, protéomique, spectrométrie de masse, stresseurs environnementaux, matrices biologiques, immunité innée, biomarqueurs.
Langues :
Communication en français et en anglais par écrit et par oral.
Lieu d'exercice :
Plateforme BioPark d'Archamps
218 avenue Marie Curie, Forum 2, ArchParc, 74160 Archamps (France).
Le dossier de candidature doit comprendre : CV, lettre de motivation. Ces documents sont à adresser à philippe.bulet@biopark-archamps.org
En savoir plus sur cette annonce sur le site de notre partenaireContexte scientifique
La faune et la flore sauvages sont confrontées à des perturbations environnementales caractérisées par des changements environnementaux mondiaux (évolutions climatiques, pollution atmosphérique, pesticides, agents pathogènes et espèces exotiques). Les insectes pollinisateurs sont confrontés à ces stresseurs environnementaux et en particulier les pesticides dont les effets sub-létaux ne sont généralement pas détectés par les normes actuelles d'analyse et la réglementation repose principalement sur les abeilles mellifères au détriment des pollinisateurs sauvages.
Notre laboratoire est spécialisé en études protéomiques et spectrométrie de masse (MS) multimodales. Pour cela, nous étudions la composition en peptides et protéines du sang et tissus de pollinisateurs.
Vous ambitionnez d'atteindre avec les partenaires de WildPosh les objectifs suivants :
1. Quantifier grâce â des outils de spectrométrie de masse les risques d'exposition aux pesticides pour des pollinisateurs sauvages représentatifs.
2. Déterminer l'impact de pesticides sur la santé de ces pollinisateurs (expériences laboratoire et en serre) en suivant la composition moléculaire de deux de leurs tissus.
3. Développer des bases de données protéomiques sur la base des analyses effectuées.
4. Proposer de nouveaux outils basés sur des analyses protéomiques d'évaluation des risques sur les pollinisateurs sauvages.
Vos missions au sein de votre laboratoire BioPark seront de :
1. Suivre les plans expérimentaux convenus avec les partenaires, et assurer la traçabilité des échantillons biologiques fournis par ceux-ci.
2. Se former à partir d'échantillons déjà disponibles au laboratoire et issus d'autres projets sur les pollinisateurs.
3. Mettre en place des procédures standardisées pour les analyses et le traitement des données générées (outil R privilégié).
4. Collecter et préparer des matrices biologiques dérivés des espèces de pollinisateurs étudiés et réaliser les analyses protéomiques par MS (MALDI, LC-ESI-MS/MS).
5. Construire les bases de données protéiques et traiter les données acquises en lien avec les données générées par les autres partenaires.
6. Respecter les bonnes pratiques de laboratoire et d'éthique concernant les modèles animaux que vous aurez à manipuler.
7. Présenter en anglais les résultats du projet (réunions et rapports d'avancement, articles scientifiques et présentations orales) et participer aux différentes réunions impliquant les partenaires et la commission européenne.
Vos missions se feront sous la responsabilité directe hiérarchique du directeur du BioPark en concertation avec les autres personnes impliquées dans ce projet.
Compétences recherchées :
- Savoir-faire et pratique effective en préparation d'échantillons biologiques, en analyses de protéines par MS (MALDI et chromatographie liquide couplée à la MS). Les équipements confiés seront (i) MALDI Sirius, (ii) Q-Exactive, (iii) Ultimate U3000 et (iv) HPLC Agilent 2590.
- Traitement de données bio-informatiques ;
- Capacités à travailler en autonomie tout en ayant un esprit d'équipe ;
- Esprit de communication, rédaction des rapports et articles scientifiques (anglais) ;
- Des connaissances dans la rédaction d'articles scientifiques en anglais seraient un plus.
Mots clés : Pollinisateurs, protéomique, spectrométrie de masse, stresseurs environnementaux, matrices biologiques, immunité innée, biomarqueurs.
Langues :
Communication en français et en anglais par écrit et par oral.
Lieu d'exercice :
Plateforme BioPark d'Archamps
218 avenue Marie Curie, Forum 2, ArchParc, 74160 Archamps (France).
Le dossier de candidature doit comprendre : CV, lettre de motivation. Ces documents sont à adresser à philippe.bulet@biopark-archamps.org
