informations générales
Colmar
ENVIRONNEMENT
Vous travaillerez dans l'unité de recherche SVQV (UMR-1131 - Santé de la Vigne et Qualité du Vin) qui associe des scientifiques et des techniciens de l'INRAE de Colmar et de l'Université de Strasbourg. L'objectif principal de l'UMR SVQV est d'étudier les interactions entre la vigne et ses agents pathogènes fongiques et viraux - y compris les vecteurs de virus - afin de développer des solutions innovantes pour une viticulture plus respectueuse de l'environnement dans le contexte du réchauffement climatique. Les recherches menées dans l'unité sont basées sur des expertises complémentaires en pathologie végétale, entomologie, génétique et métabolomique. Vous ferez partie de l'équipe Virologie Vection qui se concentre plus spécifiquement sur (i) le développement de stratégies de résistance vis-à-vis du virus responsable de la maladie du court-noué (Grapevine fanleaf virus, GFLV) et (ii) sur l'identification des facteurs impliqués dans la transmission du virus par différents vecteurs (nématodes et plus particulièrement Xiphinema index, cochenilles et pucerons).
CONTEXTE SCIENTIFIQUE
Le GFLV est une menace majeure pour la viticulture mondiale. Présent dans le monde entier et touchant les 2/3 du vignoble français, il peut causer jusqu'à 80% de pertes de rendement. L'interdiction des nématicides ciblant son nématode vecteur, Xiphinema index, a laissé peu de solutions aux viticulteurs pour lutter contre ce virus.
La protection croisée - ou prémunition - est une méthode de biocontrôle visant à protéger les plantes des dommages causés par les virus pathogènes. Cette stratégie qui consiste à inoculer un ou plusieurs variants primaires peu virulents pour prévenir une infection ultérieure par des souches virulentes apparentées a été décrite pour la première fois en 1929 sur le tobacco mosaic virus. Bien que ce phénomène ait été mis en évidence pour la première fois il y a près d'un siècle, le(s) mécanisme(s) sous-jacent(s) reste(nt) mal compris. Nos travaux visent à la fois à développer la prémunition contre le GFLV au vignoble afin d'offrir aux viticulteurs une solution respectueuse de l'environnement et à comprendre le(s) mécanisme(s) sous-jacent(s) à ce phénomène.
Cette offre de poste s'inscrit dans la dynamique des travaux de recherche menés au sein de l'équipe-projet sur la prémunition en collaboration avec l'IFV et est associée au projet Vaccivine2 financé de 2022 à 2027 par le Plan National du Dépérissement du Vignoble.
VOS MISSIONS
Vous serez amené.e à : i) détecter les variants du GFLV par analyses sérologiques et moléculaires à partir de vignes et de plantes herbacées modèles (Arabidopsis thaliana et Nicotiana benthamiana) ; ii) mettre en place des expérimentations avec des plantes en serre et assurer leur suivi ainsi que la collecte des échantillons ; iii) détecter, distinguer et quantifier les variants du GFLV par analyses moléculaires (obtention d'ARNtotaux et/ou d'amplicons par RTPCR pour séquençage Illumina ; RTqPCR) et iv) analyser, synthétiser et mettre en forme les résultats. Afin d'éviter les contaminations, vous respecterez les règles de marche en avant qui permettent de dissocier quatre étapes majeures (broyage des échantillons, extraction d'acides nucléiques, pré-PCR, post-PCR).
Merci de transmettre votre CV et votre lettre de motivation.
En savoir plus sur cette annonce sur le site de notre partenaireVous travaillerez dans l'unité de recherche SVQV (UMR-1131 - Santé de la Vigne et Qualité du Vin) qui associe des scientifiques et des techniciens de l'INRAE de Colmar et de l'Université de Strasbourg. L'objectif principal de l'UMR SVQV est d'étudier les interactions entre la vigne et ses agents pathogènes fongiques et viraux - y compris les vecteurs de virus - afin de développer des solutions innovantes pour une viticulture plus respectueuse de l'environnement dans le contexte du réchauffement climatique. Les recherches menées dans l'unité sont basées sur des expertises complémentaires en pathologie végétale, entomologie, génétique et métabolomique. Vous ferez partie de l'équipe Virologie Vection qui se concentre plus spécifiquement sur (i) le développement de stratégies de résistance vis-à-vis du virus responsable de la maladie du court-noué (Grapevine fanleaf virus, GFLV) et (ii) sur l'identification des facteurs impliqués dans la transmission du virus par différents vecteurs (nématodes et plus particulièrement Xiphinema index, cochenilles et pucerons).
CONTEXTE SCIENTIFIQUE
Le GFLV est une menace majeure pour la viticulture mondiale. Présent dans le monde entier et touchant les 2/3 du vignoble français, il peut causer jusqu'à 80% de pertes de rendement. L'interdiction des nématicides ciblant son nématode vecteur, Xiphinema index, a laissé peu de solutions aux viticulteurs pour lutter contre ce virus.
La protection croisée - ou prémunition - est une méthode de biocontrôle visant à protéger les plantes des dommages causés par les virus pathogènes. Cette stratégie qui consiste à inoculer un ou plusieurs variants primaires peu virulents pour prévenir une infection ultérieure par des souches virulentes apparentées a été décrite pour la première fois en 1929 sur le tobacco mosaic virus. Bien que ce phénomène ait été mis en évidence pour la première fois il y a près d'un siècle, le(s) mécanisme(s) sous-jacent(s) reste(nt) mal compris. Nos travaux visent à la fois à développer la prémunition contre le GFLV au vignoble afin d'offrir aux viticulteurs une solution respectueuse de l'environnement et à comprendre le(s) mécanisme(s) sous-jacent(s) à ce phénomène.
Cette offre de poste s'inscrit dans la dynamique des travaux de recherche menés au sein de l'équipe-projet sur la prémunition en collaboration avec l'IFV et est associée au projet Vaccivine2 financé de 2022 à 2027 par le Plan National du Dépérissement du Vignoble.
VOS MISSIONS
Vous serez amené.e à : i) détecter les variants du GFLV par analyses sérologiques et moléculaires à partir de vignes et de plantes herbacées modèles (Arabidopsis thaliana et Nicotiana benthamiana) ; ii) mettre en place des expérimentations avec des plantes en serre et assurer leur suivi ainsi que la collecte des échantillons ; iii) détecter, distinguer et quantifier les variants du GFLV par analyses moléculaires (obtention d'ARNtotaux et/ou d'amplicons par RTPCR pour séquençage Illumina ; RTqPCR) et iv) analyser, synthétiser et mettre en forme les résultats. Afin d'éviter les contaminations, vous respecterez les règles de marche en avant qui permettent de dissocier quatre étapes majeures (broyage des échantillons, extraction d'acides nucléiques, pré-PCR, post-PCR).
Merci de transmettre votre CV et votre lettre de motivation.
